Frankrijk ontdekt nieuwe Covid-19-variant ‘IHU’, 12 besmet: The Tribune India

Parijs, 4 januari

Franse onderzoekers hebben een nieuw type Covid-virus ontdekt, mogelijk van Kameroense oorsprong, en hebben het voorlopig ‘IHU’ genoemd.

Een nieuwe variant van de afstamming genaamd B.1.640.2 zou volgens een nog niet-herziene studie, ondersteund door de Franse regering, 12 mensen in het land hebben besmet.

Het heeft 46 mutaties en 37 deleties.

“Voor twaalf SARS-patiënten die in hetzelfde geografische gebied in het zuidoosten van Frankrijk wonen, toonde deze qPCR-test deze screening op variant-geassocieerde mutaties in een atypisch bereik”, zei Philippe Colson, van IHU Mediterranee Infection, Marseille, Frankrijk.

“Het is echter te vroeg om te speculeren over de virale, epidemiologische of klinische kenmerken van de IHU-variant op basis van deze 12 gevallen”, zei Coulson.

Volgens de studie was het indicatorgeval (patiënt 1) een gevaccineerde volwassene die was teruggekeerd naar Frankrijk van een reis naar Kameroen in Centraal-Afrika.

Drie dagen na zijn terugkeer kreeg hij milde luchtwegklachten. Zijn nasofaryngeale monster dat medio november 2021 werd verzameld, zei Coulson, “onthulde een atypische populatie die niet strookte met het delta-variantpatroon dat destijds bij bijna alle SARS-CoV-2-infecties was betrokken”, en later ook bij Omicron.

Ademhalingsmonsters verzameld van zeven andere SARS-CoV-2-positieve patiënten die in hetzelfde geografische gebied woonden, vertoonden dezelfde reeks mutaties onderzocht door qPCR. Het waren twee volwassenen en vijf kinderen (jonger dan 15 jaar).

Ademhalingsmonsters van deze acht patiënten werden naar het Universitair Ziekenhuis van het Mediterranee Institute gestuurd voor sequencing van het SARS-CoV-2-genoom, zoals aanbevolen door de Franse volksgezondheidsautoriteiten.

Aanvullende tests leidden tot de identificatie van het SARS-CoV-2-genotype. De analyse bracht 46 mutaties en 37 deleties aan het licht, resulterend in 30 aminozuursubstituties en 12 deleties. Veertien aminozuursubstituties, waaronder N501Y en E484K, en 9 deleties zijn aanwezig in het spike-eiwit.

“Dit genotype leidde tot de creatie van een nieuwe pangolin-stam genaamd B.1.640.2, een zustergroep van evolutie naar de oude stam B.1.640 omgedoopt tot B.1.640.1. Beide stammen verschillen door 25 nucleotidesubstituties en 33 deleties, ” zei studie.

“De combinatie van mutaties en de fylogenetische locatie van de genomen die hier is verkregen, geeft, op basis van onze vorige definitie, een nieuwe variant aan die we IHU noemden,” zei Coulson.

De gegevens, voegde hij eraan toe, zijn “een ander voorbeeld van de onvoorspelbaarheid van de opkomst van SARS-CoV-2-varianten”.

“Over het algemeen tonen deze waarnemingen opnieuw de onvoorspelbaarheid aan van de opkomst en introductie van nieuwe varianten van SARS-CoV-2 van buitenaf, en ze vertegenwoordigen de moeilijkheid om deze introductie en daaropvolgende verspreiding te beheersen”, zei Coulson.

“SARS-CoV-2-varianten zijn een groot virologisch, epidemiologisch en klinisch probleem geworden, met name met betrekking tot het risico om te ontsnappen aan door vaccin geïnduceerde immuniteit. De opkomst van de nieuwe variant vraagt ​​om meer genetisch toezicht op SARS-CoV-2, ” hij zei.

– Jans