Van T-cellen die al bestonden met het SARS-CoV-2-virus wordt verwacht dat ze de nieuwe Pirola-variant herkennen

SARS-CoV-2-varianten blijven evolueren (ook al halen ze niet langer de krantenkoppen). In augustus ontdekten onderzoekers een “zorgwekkende variant” van SARS-CoV-2 bij patiënten, eerst in Israël en Denemarken. De afgelopen maanden heeft deze variant, BA.2.86 of ‘Pirola’, zijn weg over de hele wereld gevonden. De Pirola-variant heeft alarm geslagen omdat deze sterk gemuteerd is, vergeleken met de mutatieniveaus die te zien zijn in de Omicron-variant.

“Er bestaat bezorgdheid dat een virus met zoveel mutaties aan de T-celimmuniteit zou kunnen ontsnappen”, zegt Alessandro Sette, DrBiolSci, professor in het Center for Vaccine Innovation van het La Jolla Instituut voor Immunologie (LJI).

Vanwege deze zorgen probeerden onderzoekers vast te stellen of eerdere vaccinatie tegen het coronavirus (of eerdere blootstelling aan SARS-CoV-2) mensen tegen ernstige ziekten zou kunnen beschermen. Nu voorspelt nieuw onderzoek de impact van BA.2.86-geassocieerde mutaties op SARS-CoV-2-specifieke T-celreacties.

Resultaten gepubliceerd in Celgastheer en microbe op papier”Er wordt verwacht dat reeds bestaande SARS-2-specifieke T-cellen BA.2.86 herkennen,“Het suggereert dat reeds bestaande SARS-CoV-2-specifieke T-cellen BA.2.86 kunnen herkennen.

“Onze analyse suggereert dat er positief nieuws is”, zegt Alba Griffoni, Ph.D., universitair hoofddocent onderzoek bij LJI. “Het lijkt erop dat eerdere blootstelling aan Omicron – of vaccinatie met nieuwere bivalente vaccins – iemand kan bewapenen met T-cellen die de achterstand kunnen inhalen en speciale reacties kunnen genereren om Pyrulla te bestrijden.”

De onderzoekers gebruikten de Immune Epitopes Database (IEDB) die gegevens bevat – verzameld door immunologen van over de hele wereld – die beschrijven hoe immuuncellen epitopen op microben herkennen. De onderzoekers verzamelden eerst gegevens over hoe COVID-19-vaccins of eerdere blootstelling aan SARS-CoV-2 ertoe leiden dat T-cellen zich richten op SARS-CoV-2-epitopen. Vervolgens ontwikkelden ze een pijplijn voor bio-informatica om de T-celreactie op Pirola te simuleren op basis van experimentele en voorspelde gegevens van eerdere SARS-CoV-2-varianten.

De onderzoekers ontdekten dat de meeste T-cellen zich nog steeds kunnen richten op epitopen die in Pyrula worden aangetroffen. Meer specifiek werd tussen de varianten 72% van de fragmenten die werden herkend door CD4+-helper-T-celreacties en 89% van de CD8+-killer-T-cel-epitopen geconserveerd.

Een kleiner aantal geconserveerde T-celepitopen werd gevonden in Pirola’s spike-eiwit. Slechts 56% van de CD4+ T-celepitopen en CD8+ T-celepitopen waren op het spike-eiwit geconserveerd. Toen de onderzoekers de piekfragmenten echter nader bekeken, ontdekten ze dat 96% van de CD4+ T-celepitopen en 62% van de CD8+ T-celepitopen zo vergelijkbaar waren dat van de T-cellen zou worden verwacht dat ze ze zouden herkennen.

“Veel van de epitopen die het immuunsysteem herkent, zijn nog steeds geconserveerd in de nieuwe Pirola-variant”, zegt Sit. “We verwachten sterk dat T-cellen het virus zullen blijven herkennen.”

“T-cellen kunnen mogelijk ook achter nieuw gemuteerde pyrrola-peptiden aan rennen om een ​​nieuwe reactie tegen die epitopen op te wekken, zoals te zien is bij de andere varianten,” voegt Grifoni toe. “We denken dat dit een rol kan spelen in de reden waarom we, ondanks de virale evolutie, geen ernstigere ziekten zien in gevallen van Burula-infectie of andere nieuwere varianten.”

Griffoni benadrukt dat deze resultaten slechts voorspellingen zijn en geen observaties gebaseerd op daadwerkelijke Berula-infecties. Ze vindt het echter belangrijk om te zien hoe deze ‘realistische’ voorspellingen worden weerspiegeld in recente onderzoeken in de echte wereld. “We hebben nog steeds experimentele validatie nodig, maar we hebben over de hele wereld verschillende samenwerkingsverbanden opgezet die zich op dit moment bezighouden met dit onderwerp”, zegt Griffoni.

Seet voegt eraan toe dat veel mensen nog steeds vatbaar zijn voor SARS-CoV-2-infectie, zelfs de Pirola-variant. “Daarom moeten mensen gevaccineerd blijven, vooral met bijgewerkte vaccins.”

Onderzoekers verzamelen momenteel experimentele gegevens om meer te leren over T-celreacties op varianten en om hun voorspellingsinstrumenten te verbeteren. Griffoni is vooral benieuwd hoe mensen die bivalente vaccinboosters en/of “doorbraak”-infecties hebben gekregen, T-celreacties tegen toekomstige varianten opbouwen.