Genmapping van tumoren onthult hoe kankers groeien

Neurologie – tomografie. – © AFP

Wetenschappers van Oxford University, KTH Royal Institute of Technology, Science for Life Laboratory en Karolinska Institutet, Solna, Zweden, werkten samen en ontdekten dat individuele prostaattumoren een onbekende reeks genetische variaties bevatten.

Het definiëren van de overgang van goedaardig naar kwaadaardig weefsel is van fundamenteel belang voor het verbeteren van de vroege diagnose van kanker en het nieuwe onderzoek maakt deel uit van deze poging om medisch inzicht in dit proces te vergroten.

deze belangrijke stap in Medisch onderzoek van kankers Omdat het begrijpen van de cellen die kankergebieden veroorzaken, het medisch begrip van hoe een tumor groeit en zich ontwikkelt, kan verbeteren. Een belangrijke overweging is hoe de tumor in de loop van de tijd genetisch is veranderd.

Dit is ontwikkeld met behulp van een nieuwe technologie, ruimtelijke transcriptie genaamd, waarmee wetenschappers kunnen zien welke genetische veranderingen plaatsvinden zonder het weefsel af te breken waarnaar ze op zoek zijn. Dit proces voegt een nieuwe dimensie toe die onderzoekers nu hebben gebruikt om te onthullen welke cellen zijn gemuteerd en waar in het ecosysteem van het orgel.

huidige technologieën Om de genen van cellen in tumoren te bestuderen, moet een monster worden genomen uit het kankergebied en moet het DNA van deze cellen worden geanalyseerd. De beperking hier is dat veel kankers, zoals prostaatkanker, 3D zijn, wat betekent dat elk monster slechts een kleine momentopname van de tumor zal geven.

In de nieuwe studie gebruikten de onderzoekers ruimtelijke transcriptie om een ​​transversale kaart van de gehele prostaat te maken, inclusief gebieden met gezonde en kankercellen. Ze toonden aan dat ze, door cellen te groeperen op basis van vergelijkbare genetische identiteit, verrast waren om gebieden van zogenaamd gezond weefsel te zien die in feite veel van de genetische kenmerken van kanker bevatten.

Deze ontdekking was verrassend vanwege de genetische variabiliteit binnen weefsels en het grote aantal cellen dat als gezond kan worden beschouwd, maar mutaties bevatten die meestal worden geïdentificeerd met kankercellen.

Een belangrijke bevinding is dat het aantal kopieën waarvan eerder werd gedacht dat ze specifiek verband hielden met kanker, al aanwezig zijn in goedaardige weefsels. Dit heeft grote implicaties voor de diagnose en mogelijk ook voor het identificeren van de delen van de kanker die behandeling nodig hebben.

Bovendien zouden de bereikte adviezen met hoge resolutie van invloed moeten zijn op de manier waarop complexe ecosystemen zoals kanker worden behandeld. Dit wordt geëxtraheerd door analyse van meer dan 150.000 regio’s in drie prostaten, twee borstkankers, een deel van de huid, lymfeklieren en wat hersenweefsel, en vervolgens een algoritme te ontwikkelen om groepen cellen met vergelijkbare genetische veranderingen te volgen. Evolutie toont in het tijdschrift temper de natuur, “Klonale kopienummerveranderingen die ruimtelijk worden opgelost in goedaardige en kwaadaardige weefsels.”